La central sindical Union of Autonomous Trade Unions of Croatia (UATUC) denuncia la práctica habitual entre los empleadores de cambiar las condiciones de trabajo para aquellos trabajadores que sean miembros de un sindicato, para intimidarlos y presionarlos a desafiliarse. Es frecuente que un trabajador que se haya convertido en representante sindical tenga menos oportunidades de promoción. Muchas veces se intenta disuadir a los trabajadores de afiliarse al sindicato, incluso amenazándolos con no renovar sus contratos. En ocasiones se llega incluso a ofrecerles dinero para desafiliarse, especialmente en sectores donde la mano de obra es particularmente vulnerable, como en el sector minorista. Otros casos de discriminación antisindical incluyen la imposición de horas extraordinarias y limitar el derecho a permisos; amenazas de despido; ofertas de contratos con términos menos favorables, incluyendo salario inferior; cambios en la distribución de horas de trabajo; cambios en la localización del trabajo (enviando a trabajadores a lugares remotos donde los enlaces sindicales no pueden establecer contacto con ellos).
La magnitud real del problema es difícil de evaluar de manera objetiva, ya que muchas veces no se comunica y resulta complicado probar una discriminación (directa) por esos motivos.